2、單核苷酸多態(tài)性和小片段插入與缺失的分析

與參考基因組相比，Yarrowia lipolytica BBE-17共有43921個(gè)單核苷酸多態(tài)性（SNP）變化（圖3），其中42577個(gè)是純合SNP，1344個(gè)是雜合SNP，27515個(gè)是轉(zhuǎn)換的SNP，16406個(gè)是顛換的SNP，有7871個(gè)是同義突變，3711個(gè)是非同義突變；位于基因間區(qū)的SNP突變有32339個(gè)，每1000bp序列平均有2.4個(gè)單核苷酸多態(tài)性變化。整個(gè)基因組有8078個(gè)小片段插與缺失變化（InDel），其中插入的片段是3924個(gè)，缺失的片段是4154個(gè)，有7740個(gè)是純合變化，有338個(gè)是雜合變化。有4256個(gè)基因發(fā)生了單核苷酸多態(tài)性變化，但是沒有基因發(fā)生小片段插入或缺失的變化。

3、基因組結(jié)構(gòu)變異分析

基因組結(jié)構(gòu)變異（SV）指基因組水平上大片段的插入，缺失、倒置、易位等序列。與參考基因組比對發(fā)現(xiàn)，有129個(gè)大片段的基因組結(jié)構(gòu)變異（圖4）。其中缺失片段106個(gè)，倒置片段2個(gè)，染色體內(nèi)部遷移7個(gè)，染色體間的遷移14個(gè)，有44個(gè)發(fā)生在基因間區(qū)，64個(gè)結(jié)構(gòu)變異發(fā)生在基因中。份BBE-17結(jié)構(gòu)變異所涉及的基因有109個(gè)，全部為缺失型變化（表1）。

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