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甘藍(lán)型油菜乙酰轉(zhuǎn)移酶基因的克隆及功能驗(yàn)證(一)

發(fā)布時(shí)間:2021-08-01 15:54 編輯者:特邀作者周世紅

隨著人們生活質(zhì)量的提高和對(duì)食品營(yíng)養(yǎng)保健功能認(rèn)識(shí)的加強(qiáng),我國(guó)食用植物油的需求不斷增加,油菜是我國(guó)重要的油料和經(jīng)濟(jì)作物之一,菜籽油不僅富含人體所必需的氨基酸和脂肪酸,而且能較長(zhǎng)時(shí)間地儲(chǔ)存,為了更好地滿足廣大人民對(duì)優(yōu)質(zhì)食用植物油的需求,菜籽油品質(zhì)改良已成為當(dāng)前油菜育種領(lǐng)域的熱點(diǎn)。

菜籽油的主要成分是脂肪酸,油脂的優(yōu)劣由脂肪酸決定,而油脂脂肪酸的好壞則主要取決于其碳?xì)滏滐柡统潭取V舅岣鶕?jù)碳?xì)滏滐柡团c不飽和分為3類:飽和脂肪酸(主要有棕櫚酸、硬脂酸等)、單不飽和脂肪酸(油酸、芥酸等)和多不飽和脂肪酸(亞油酸、亞麻酸等),有研究表明,預(yù)防冠心病的指導(dǎo)方針集中在將飲食中的飽和脂肪和反式脂肪轉(zhuǎn)變?yōu)椴伙柡椭?飽和脂肪酸熔點(diǎn)較高,易凝固在血管壁上,從而導(dǎo)致高血壓和動(dòng)脈粥樣硬化,且飽和脂肪酸還導(dǎo)致血膽固醇濃度上升,不飽和脂肪酸熔點(diǎn)較低,容易被人體吸收。

本研究以湖南省水稻油菜抗病重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室前期對(duì)高亞麻酸甘藍(lán)型油菜(Brassicanapus)近等基因系進(jìn)行的miRNA測(cè)序結(jié)果為基礎(chǔ),篩選到的與脂肪酸代謝相關(guān)的bna-miR396及其靶基因乙酰轉(zhuǎn)移酶基因(Acetyltransferasegene,AT)。研究表明,AT通過(guò)催化乙酰基團(tuán)從乙酰輔酶A(乙酰CoA,AcetylCoA)轉(zhuǎn)移到其作用底物芳香胺及雜環(huán)胺類物質(zhì)上,參與脂肪酸轉(zhuǎn)化與降解,AT缺失會(huì)推遲植物開(kāi)花時(shí)間并降低育性。利用同源基因克隆,得到AT基因的2個(gè)拷貝,分別構(gòu)建過(guò)表達(dá)載體與干擾載體,轉(zhuǎn)化擬南芥,分析轉(zhuǎn)基因擬南芥后代種子脂肪酸組成,探究該基因在脂肪酸合成過(guò)程的功能,以期促進(jìn)甘藍(lán)型油菜脂肪合成分子機(jī)理研究。

1 材料和方法

1.1 試驗(yàn)材料

高亞麻酸甘藍(lán)型油菜近等基因系(低亞麻酸株系575,亞麻酸含量為5.1%;高亞麻酸株系574,亞麻酸含量9.8%),野生型擬南芥(WT)由湖南農(nóng)業(yè)大學(xué)國(guó)家油料改良中心提供。大腸桿菌感受態(tài)DH5α,限制性內(nèi)切酶、dNTP、T4DNALigationKit購(gòu)自北京擎科生物科技有限公司;pMD18-T載體由本實(shí)驗(yàn)室保存;pCambia1300-35s-N1、pCambia1300-RNAi載體購(gòu)于上??殿伾锟萍加邢薰?;本試驗(yàn)中所用到的引物均由北京擎科合成。

1.2 AT基因克隆

利用數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行檢索,發(fā)現(xiàn)AT基因有2個(gè)拷貝,分別在A基因組和C基因組,并以此序列(GSBRNA2T00114025001、GSBRNA2T00148464001)進(jìn)行后續(xù)引物設(shè)計(jì)(表1),其中5′端酶切位點(diǎn)前的序列用于重組連接。

采用TransZolUP植物總RNA提取試劑盒(北京全式金)提取低亞麻酸甘藍(lán)型油菜株系575自交授粉后20~35d混合種子總RNA,并用TransScriptOne-StepgDNARemovalandcDNASynthesisSuperMix反轉(zhuǎn)錄試劑盒(北京全式金)合成cDNA第一鏈,以此為模板,進(jìn)行PCR擴(kuò)增,擴(kuò)增體系包含KOD-FX聚合酶1μL,2×PCRBuffer25μL,dNTP(2.5μmol/L)10μL,正反向引物各0.2μmol/L,cDNA小于500ng,用ddH2O補(bǔ)足至50μL。反應(yīng)條件為98℃2min預(yù)變性;98℃10s,60℃30s,68℃2min,35個(gè)循環(huán);68℃7min延伸。

經(jīng)PCR純化回收后,與pMD18-T載體相連,轉(zhuǎn)化到大腸桿菌中,由北京擎科公司進(jìn)行測(cè)序。

1.3 生物信息學(xué)分析

用SnapGene3.2.1將克隆到的靶基因序列翻譯成氨基酸,經(jīng)NCBI數(shù)據(jù)庫(kù)BlastP進(jìn)行鑒定后,預(yù)測(cè)對(duì)應(yīng)蛋白的一級(jí)結(jié)構(gòu),包括氨基酸組成、理化性質(zhì)等;分別登錄PredictProtein、SOPMATMHMM網(wǎng)站進(jìn)行蛋白亞細(xì)胞定位預(yù)測(cè)、結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)、跨膜螺旋區(qū)分析;通過(guò)SWISS-MQPEL構(gòu)建蛋白三級(jí)結(jié)構(gòu)模型。

1.5 過(guò)表達(dá)載體與RNAi干擾載體構(gòu)建

用BamHI和SalI雙酶切pCambia1300-35s-N1載體,膠回收,產(chǎn)物進(jìn)行體外同源重組反應(yīng),獲得重組質(zhì)粒。

用XbaI及BamHI雙酶切pCambial300-RNAi載體以及各個(gè)基因的RNAi片段的PCR產(chǎn)物,具體方法參考劉芳等,并進(jìn)行改進(jìn),膠回收后進(jìn)行連接,獲得重組質(zhì)粒。測(cè)序檢驗(yàn)正確后,用PstI和Sal.I雙酶切重組質(zhì)粒及各個(gè)基因的RNAi片段的PCR產(chǎn)物,再次進(jìn)行連接,轉(zhuǎn)化,獲得最終的RNAi載體。

將構(gòu)建好的過(guò)表達(dá)載體與RNAi干擾載體轉(zhuǎn)入農(nóng)桿菌中,以野生型擬南芥為受體,進(jìn)行基因轉(zhuǎn)化,獲得T0種子;用潮霉素篩選T0擬南芥陽(yáng)性苗并種植,之后,用PCR鑒定轉(zhuǎn)基因苗,收取得到T1種子。

1.6 脂肪酸成分測(cè)定

采用SP-6890型氣相色譜儀、FID檢測(cè)器、N3000色譜工作站、毛細(xì)管色譜柱DB-23對(duì)轉(zhuǎn)基因擬南芥T1種子進(jìn)行脂肪酸成分測(cè)定,對(duì)7個(gè)主要的脂肪酸成分進(jìn)行分析,測(cè)定時(shí)取5個(gè)轉(zhuǎn)基因后代株系,每個(gè)材料檢測(cè)約30粒種子。

2 結(jié)果與分析

2.1 靶基因與特異干擾片段克隆及檢測(cè)結(jié)果

以低亞麻酸甘藍(lán)型油菜20~35d自交種cDNA為模板,高保真擴(kuò)增了乙酰轉(zhuǎn)移酶基因的2個(gè)拷貝,大小均為1350bp。分別對(duì)2個(gè)靶基因特異片段進(jìn)行PCR高保真擴(kuò)增,得到了目的片段長(zhǎng)度大小的DNA片段。

2.2 生物信息學(xué)分析

2.2.1 蛋白質(zhì)一級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)與分析

以SnapGene3.2.1分別對(duì)AT基因翻譯出來(lái)的氨基酸序列,通過(guò)ExPASy-ProtParamtool進(jìn)行理化性質(zhì)分析表明(表3),AT基因的2個(gè)拷貝114與148氨基酸均為449個(gè),分子量約50.5ku,114編碼的氨基酸偏中性而148編碼的蛋白偏堿性。不穩(wěn)定系數(shù)顯示114與148均為穩(wěn)定蛋白,且親水性較差,屬于脂溶性蛋白。

聲明:本文所用圖片、文字來(lái)源《華北農(nóng)學(xué)報(bào)》,版權(quán)歸原作者所有。如涉及作品內(nèi)容、版權(quán)等問(wèn)題,請(qǐng)與本網(wǎng)聯(lián)系

相關(guān)鏈接:油菜,乙酰輔酶A,亞麻酸,大腸桿菌

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